无证运输木材的处罚措施主要包括以下几点：
责令限期补办证件 ：对于无木材运输证件运输木材的货主，林业主管部门会责令其限期补办木材运输证件。如果货主逾期不补办且无正当理由，将没收所运输的全部木材，并处以相当于没收木材价款的10-30%的罚款。没收非法运输的木材：
货主如果无法提供合法的木材来源证明，林业主管部门可以先将所运输的木材予以扣留，并通知货主或承运人在规定的限期内接受处理。如果逾期不接受处理，将没收所运输的全部木材。
罚款
无木材运输证件运输木材的，可以对货主处以非法运输木材价款30%以下的罚款。
运输木材数量超出木材运输证所准运的运输数量的，没收超出部分的木材。
运输的木材树种、材种或规格与运输证件记载全部或部分不符又无正当理由的，没收其不符部分的木材。
使用伪造、倒卖、涂改木材运输证件的，收缴其运输证件，没收所运输的全部木材，并对货主处以相当于木材价款的10-50%的罚款。
其他处罚
承运无木材运输证的木材的，可以处其所承运木材价款的30%以下的罚款。
使用过期木材运输证件运输木材，能够提供木材合法来源证明的，限期补办木材运输证件后放行；逾期未提供木材运输证件和木材合法来源证明的，没收所运输的全部木材。
以暴力威胁、殴打木材检查员或使用其他方式阻挠检查、强行冲关拒绝检查的，除按上述规定处理外，由司法机关依法处理。
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