增值税抵扣凭证主要包括以下几种：
增值税专用发票
包括电子发票（增值税专用发票）和纸质发票。
纳税人销售货物或提供应税劳务开具的发票，购买方可以据此抵扣增值税进项税额。
海关进口增值税专用缴款书
纳税人从境外进口货物时，由海关代征的增值税，纳税人取得缴款书后可以抵扣。
农产品收购发票或销售发票
纳税人购进农产品时，除了增值税专用发票或海关进口增值税专用缴款书外，还可以使用农产品收购发票或销售发票上注明的买价和扣除率计算进项税额。
代扣代缴的完税凭证
纳税人从境外单位或个人购进服务、无形资产或不动产时，取得的完税凭证上注明的增值税额可以抵扣。
机动车销售统一发票
纳税人购进车辆时取得的发票，上面注明的税额可以作为进项税额抵扣。
通行费发票
包括道路、桥、闸通行费发票，纳税人支付的费用可以按规定抵扣进项税额。
旅客运输凭证
纳税人购进国内旅客运输服务时，其进项税额允许抵扣。
以上凭证必须满足一定条件，如在规定时间内认证，并在规定的纳税申报期内申报抵扣。小规模纳税人通常不允许抵扣
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