补交土地出让金的计算通常遵循以下步骤和规则：
基准地价 ：根据土地所在级别和当地政府评估的土地基础价格确定。土地使用年限：
考虑土地使用权的剩余年限。
土地用途：
根据土地用途（如住宅、商业、工业等）确定不同的出让金标准。
溢价：
根据市场情况和土地稀缺性确定的额外费用。
计算公式：
补交土地出让金 = 基准地价 × 土地使用年限系数 × 土地用途系数 + 溢价。
特殊情况
若土地有实际成交价格，并且不低于所在级别基准地价平均标准，则按成交价不低于40%的标准计算出让金。
若成交价低于基准地价平均标准，则按照全部地价的40%计算。
对于转让的划拨土地使用权补办出让，通常按照基准地价平均标准的40%计算。
如果土地使用权受让人对计算结果有异议，可以委托有资质的土地估价机构进行评估，然后按照评估价的40%计算补交土地出让金。
对于已购公有住房和经济适用住房上市出售，补交土地出让金的计算可能采用特定的公式，如标定地价乘以缴纳比例、上市房屋分摊土地面积、年期修正系数等。
请注意，具体的计算方法和比例可能因地区、时间和政策的不同而有所变化。在实际操作中，应以当地最新的政策和规定为准，并咨询当地土地管理部门或专业土地估价机构获取详细信息。
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